Протеини по поръчка: нобелистът Бейкър и Nvidia отвориха ИИ модела RFD4-Proteina
Институтът за дизайн на протеини към Вашингтонския университет и Nvidia представиха отворен ИИ модел за създаване на нови протеини. Той трябва да дава 5 до 10 пъти повече успешни резултати.
Снимка: Arthur Petron / Wikimedia Commons, CC BY-SA 4.0 (изрязана и мащабирана)
Видео: YouTube · NVIDIA · youtube.com
Институтът за дизайн на протеини (IPD) към Вашингтонския университет и чиповият концерн Nvidia са разработили съвместно ИИ модела RFD4-Proteina. Той проектира протеини с целеви функции и съчетава линията RosettaFold Diffusion на IPD с модела Proteina-Complexa на Nvidia. Особеното е, че моделът настройва последователността и структурата на протеина заедно с молекулите, с които той трябва да взаимодейства – при промяна в една част останалите се актуализират. При трудни задачи той може да използва повече изчислително време.
По данни на университета успеваемостта при изчислителни сравнителни тестове е 5 до 10 пъти по-висока, отколкото при по-ранни модели, а кандидатите се генерират 5 до 10 пъти по-бързо. Моделът е свободно достъпен под отворения лиценз BSD-3. „RFD4-Proteina ще отвори вратата към нови решения в медицината, устойчивостта, материалите и биотехнологиите“, каза директорът на IPD Дейвид Бейкър, носител на Нобеловата награда за химия за 2024 г.
Първите потребители от института съобщават за бързи резултати: докторантът Сет Удбъри каза, че „само за няколко дни“ са проектирали ензим за разграждане на пестициди, който работи многократно по-добре от най-добрия му досега. Проектът е ръководен от докторантите Натаниел Корли, Максуел Казман и Рафи Брент.
